從月經第一天到下次月經的前一天為一個月經週期，一般女性的月經週期平均是21至35天，最常見的月經週期通常是28天、月經期持續4至7天。
月經周期大致可以分為以下四個階段：
1. 月經期
是月經周期的開始，通常會持續3-7天。在這個階段，子宮內膜會開始脫落，並從陰道出血。這是因為體內的荷爾蒙水平下降，導致子宮內膜脫落。
2. 濾泡期（或稱卵巢的濾泡階段）
通常在月經期結束後開始，並持續約一個星期。在此期間，腦部的垂體會釋放促卵泡激素 (FSH)，使得卵巢中的幾個卵泡開始成熟。這些卵泡中，通常只有一個能成為主導卵泡，並最終釋放出一個卵子。在這個階段，子宮內膜也開始再度增厚，以準備可能的受精。
3. 排卵期
月經周期的中點，通常在月經周期的第14天左右（在一個28天的周期中）。在這個階段，卵巢釋放出一個成熟的卵子，這被稱為排卵。排卵是由腦部的垂體釋放的黃體生成激素 (LH) 觸發的。排卵後的卵子將會進入輸卵管，等待可能的受精。
4. 黃體期
這個階段開始於排卵後，並持續約兩週。排卵後的卵巢形成一個被稱為黃體的結構。黃體會釋放大量的賀爾蒙，如黃體酮和雌激素，這些激素會進一步刺激子宮內膜增厚。如果卵子在輸卵管中受精，它將在這個階段著床於子宮內膜。如果沒有發生受精，黃體會退化，賀爾蒙水平會下降，子宮內膜會開始脫落，並開始新的月經周期。